Но каменные стены Дзивгиса, изрезанные ветрами и наконечниками стрел, помнят и более ранние события. В XV веке пещерное укрепление атаковали войска Тамерлана. Еще раньше недалеко от боевых башен появилось одно из первых массовых воинских захоронений, которое также стало результатом ожесточенных боев. Обнаружено захоронение было недавно, а анализ останков позволил датировать первых воинов Дзивгиса XIII веком нашей эры. Свое прямое назначение крепостные стены выполняли вплоть до XIX века, когда сильно пострадали в ходе карательных экспедиций Российской империи.